У мокрому скрубері використовується морська вода або прісна вода з хімічними добавками. Найчастіше використовуються каустична сода (NaOH) і вапняк (CaCO3). Очищувальна рідина розпилюється в потік вихлопних газів через форсунки для її ефективного розподілу.
У більшості скруберів конструкція така, що миюча рідина рухається вниз за течією; однак доступні також скрубери з висхідним рухом миючої рідини.
Забір вихлопних газів здійснюється збоку або знизу вежі. Конструкція гарантує, що оксиди сірки, присутні у вихлопних газах, проходять через очищувальну рідину, вступаючи з нею в реакцію з утворенням сірчаної кислоти.
При розведенні лужною морською водою можна нейтралізувати сірчану кислоту (яка є дуже корозійною за своєю природою). Промивні води скидаються у відкрите море після обробки в сепараторі для видалення осаду, а очищені вихлопні гази виводяться з системи.
Туманоуловлювачі використовуються в скрубберних вежах для видалення кислотного туману, який утворюється в камері, шляхом відділення крапель, присутніх у вхідному газі, від вихідного газового потоку. Правила MARPOL вимагають, щоб промивна вода контролювалася перед скиданням, щоб переконатися, що її значення PH не є занадто низьким.
Скрубберна система з відкритим циклом
Ця система використовує морську воду як очищувальне та нейтралізуюче середовище; додаткові хімічні речовини не потрібні. Потік вихлопних газів від двигуна або котла потрапляє в скрубер і обробляється тільки лужною морською водою - об'єм цієї води залежить від розміру двигуна і його потужності.
Ця система надзвичайно ефективна, але потребує великої потужності насосів, оскільки використовує велику кількість морської води. Система з відкритим циклом добре працює, коли морська вода, що використовується для промивання, має достатню лужність, але морська вода з високою температурою навколишнього середовища, а також прісна або солонувата вода є неефективною і не може бути використана.
З цих причин скрубер з відкритим циклом не вважається придатною технологією для таких регіонів, як Балтійське море, де рівень солоності не є високим.
Система скруберів із замкнутим циклом
Замкнута система працює за тими ж принципами, що й відкрита: вона використовує прісну воду, оброблену хімічною речовиною (зазвичай гідроксидом натрію), а не морську воду в якості очисного середовища. SOx з потоку вихлопних газів перетворюється на нешкідливий сульфат натрію.
Перед повторною циркуляцією для використання промивна вода із замкненої системи скруберів проходить через технологічний резервуар, де вона очищується. Судна можуть перевозити прісну воду в танках або виробляти необхідну кількість води за допомогою прісноводних генераторів на борту.
Невеликі об'єми промивної води через певні проміжки часу відводяться у відстійники, куди можна додавати свіжу воду, щоб уникнути накопичення сульфату натрію в системі. Замкнута система потребує майже вдвічі меншого об'єму промивної води, ніж відкрита, але для неї потрібна більша кількість резервуарів.
До них відносяться технологічний або буферний резервуар, відстійник, через який заборонено скидання в море, а також резервуар для зберігання гідроксиду натрію, який зазвичай використовується у вигляді 50% водного розчину, з можливістю регулювання його температури в діапазоні від 20º до 50ºC.
